A pour mission de soutenir les actions d'éducation, de conservation et de recherche des Muséums nature que sont le Biodôme, l'Insectarium, le Jardin botanique et le Planétarium de Montréal. Pour ce faire, elle recueille des fonds qui permettent aux Muséums nature de réaliser leurs projets de développement prioritaires. La Fondation contribue ainsi à l'avancement des sciences naturelles, de la culture scientifique et alimente l'intérêt de la population pour l'environnement, le développement durable et la préservation de la biodiversité. En intervenant sur les plans éducatif, scientifique, culturel, social et artistique, la Fondation sème l'envie de découvrir les sciences et permet de lever le voile sur certains secrets de la nature. Elle contribue ainsi à mettre en valeur et à préserver notre patrimoine naturel pour les générations présentes et futures.